Специальный агент ФБР "Призрачный" Фокс Малдер увлечен исследованием паранормальных явлений. Веря воспоминаниям (полученным во время сеанса регрессивного гипноза) того, что его сестра в детстве была похищена неземной силой, он надеется докопаться до истины, скрытой в Секретных Материалах (X-Files), засекреченное хранилище необъяснимых и сверхъестественных дел ФБР.

Завербованный в Бюро после обучения психологии в Оксфорде, Малдер не проявил интереса к продвижению по служебной леснице, развитию карьеры. Его ранняя работа на тему серийных убийц и оккультных обрядов привела к поимке известного убийцы. Но вместо того чтобы думать о начале своей звездной карьеры в ФБР, Малдер выбрал кабинет в подвале, где Бюро хранит Секретные Материалы. Только его связи в Конгрессе и некоторых других инстанциях позволили ему продолжить расследования в этой области на фоне официального безразличия и скрытой оппозиции властей. У Малдера, окруженного неприятелями и врагами в ФБР и за его пределами, есть единственный человек, которому он может по-настоящему доверять - его партнерша, Дана Скалли.